自70年前推出以来, 抗生素已被用于治疗细菌感染的病人. 随着时间的推移, 许多传染性生物已经适应了旨在杀死它们的药物, 使这些治疗效果降低.
范Opijnen, 生物学助理教授和该基金的项目主管, 与BC大学计算机科学助理教授约瑟·本托, 这个复杂项目的五个主要太阳城官网人员之一, 包括范·奥皮宁, 塔夫茨大学萨克勒太阳城官网生生物医学科学学院教授拉尔夫·伊斯伯格, St. Jude儿童太阳城官网医院教授Jason Rosch和匹兹堡大学医学院教授Vaughn Cooper说.
该项目将使用尖端的基因组学太阳城官网工具和技术, 包括转座子测序, 或Tn-seq, 这项技术可以快速梳理数以百万计的基因序列，并在细菌中挑选出基因功能. 范Opijnen开发了n-seq, 他用这种方法来识别细菌中的某些基因，这些基因支持细菌摆脱免疫系统的抗病能力.
“我们希望全面确定细菌如何与患者的免疫系统相互作用，以及这些相互作用如何允许或阻止抗生素耐药性的演变,van Opijnen说.
该团队将使用大容量基因组测序, 全基因组测序, 免疫系统监测, 神经网络和主动学习技术, 是由美国国立卫生太阳城官网院下属的国家过敏和传染病太阳城官网所资助的.
这项资助将进化生物学家聚集在一起, 传染病专家, 计算机科学家和数学家正在努力改进高通量测序产生的大量数据的使用, van Opijnen说.
“生物学充斥着数据, 但我们的分析工具可以比现在复杂得多,他说. “我们需要达到这种复杂程度的是与其他学科的交叉，而现在这种交叉并不经常发生. 这个项目是一个建立这些联系的机会.”
盒饭, 谁的工作将集中于制定指导数据分析和未来使用的说明, 同意.
“我对与蒂姆的合作感到非常兴奋，”本托说. “它专注于解决一个紧迫的问题，并提出可能有助于解决其他新问题的可靠新想法. 蒂姆和我都必须学习如何说另一门学科的新“语言”，我希望这样做能带来新的视角, 在问题和解决方案中, 他的领域和我的领域."
除了开发一个计算机模型来指导最佳治疗, van Opijnen说，额外的治疗应用可能包括提高预测耐药性出现的准确性，以及开发新的抗生素靶点和治疗策略.
减少抗生素耐药性的核心是了解患者如何, 细菌, 药物相互作用.
“免疫系统对摆脱感染至关重要. 这不仅仅是药物的问题。.
“这些药物可以降低体内细菌的数量，这样免疫系统就可以清除剩下的细菌. 但是免疫系统需要与药物合作才能成功.”
埃德·海沃德|新闻 & 公共事务